Kehidupan biasa Hajime Ichinose adalah perubahan ketika seorang transenden bernama J.J Robinson memberinya sebuah buku kecil bernama CATATAN — sebuah alat yang mengubah dirinya menjadi salah satu Gatchaman, pelindung legendaris Kota Tachikawa. Menekankan bahwa keberadaan kelompok mereka harus tetap menjadi rahasia, sesama Gatchaman Sugane Tachibana membawa Hajime ke pangkalan operasi mereka, di mana Paiman, pemimpin alien yang mirip panda Gatchaman, mengungkapkan tujuan mereka: untuk menghilangkan alien yang menimbulkan bahaya bagi umat manusia . Ancaman-ancaman eksistensial ini, yang disebut MESS, menjadi semakin berbahaya, menghancurkan semua yang mereka sentuh. Sekarang terserah Gatchaman dan rekrutan baru mereka untuk menghentikan mereka sebelum dunia dilanda kekacauan.