Dunia telah kiamat dan Bumi tergantikan posisinya dengan mekanisme kerja sang jarum jam. Seorang pembuat jam terbesar Y mengembalikan Bumi dalam bentuk mekanisme jam atau lebih sering disebut clockwork. Clockwork adalah sebuah mekanisme jam yang menjadi pangkuan hidup seluruh hidup yang di dalam Bumi ini. Tetapi sang maetro Naoto Miura, seorang bocah yang bercita-cita selayanya seperti Pembuat Jam terbesar Y. Dirinya sangat unik akan kemampuannya untuk mendengar yang peka dan mengerti mekanisme kerja jarum jam, dirinya lebih maju dari orang pada jamannya. Tetapi tiba-tiba mesin robot jatuh, ialah RyuZu sebuah robot wanita yang ditempa oleh Y sendiri.
Karena ingin melihat kehidupan sang Naoto. Sebab kedatangan sang RyuZu membawa Marie Bell Berguet untuk mengajak sang Naoto bergabung. Bersamaan dengan Vainney Halter sang pengawal Marie Bell Breguet. Seketika itu juga Naoto pun ikut terlibat dalam asik penyelamatan dunia bersamaan dengan tim pemberontak ini untuk menyelamatkan dunia diambang batas kehancuranya. Oleh sebab itu perlunya tim yang akan memperbaiki keseimbangan ini.
Clockwork Planet
Salah satu yang penting disini adalah kedekatan antara Ryuzu dengan sang yang menghidupannya, Naoto dimana keduanya hidup berdampingan dan bersama. Dimana kedeketan antara RyuZu dan Naoto adalah hubungan yang benar-benar dekat dan menarik. Dimana mereka tidak bisa dipisahkan. Bagaimana mereka dekat begitu dekat sekali sehingga dapat dikatakan antara pencipta dengan apa yang dimilikinya luar biasa dekat.