Seorang siswa pindahan aneh bernama Ougi Oshino baru saja tiba di Sekolah Menengah Swasta Naoetsu. Dia dengan cepat diperkenalkan kepada siswa senior Koyomi Araragi oleh teman bersama mereka Kanbaru Suruga, dengan harapan mendapatkan saran mengenai penemuan aneh yang telah dia buat. Setelah melihat tata letak sekolah, Ougi memperhatikan bahwa ruang kelas telah muncul di area yang kosong – tempat yang seharusnya tidak ada.
Tidak yakin apakah ini adalah karya penampakan, Araragi dan Ougi berusaha mengungkap kebenaran di balik teka-teki ini. Tetapi Araragi segera menemukan, setelah mendapati dirinya terkunci dengan Ougi, bahwa ruangan itu menyimpan memori dari suatu peristiwa yang sudah lama dilupakannya.