Tahun ini 2071. Kemanusiaan telah terdesak ke ambang kepunahan menyusul munculnya monster pemakan manusia yang disebut “Aragami” yang membanggakan kekebalan terhadap persenjataan konvensional. Mereka merusak tanah, memakan hampir semua yang ada di jalan mereka dan tidak meninggalkan apa pun di belakang mereka. Untuk melawan mereka, organisasi bernama Fenrir dibentuk sebagai upaya terakhir untuk menyelamatkan manusia melalui penggunaan “God Eaters” – manusia istimewa yang diinfus dengan sel Oracle, memungkinkan mereka untuk menggunakan Busur Dewa, satu-satunya senjata yang dikenal mampu membunuh sebuah Aragami. Salah satu Pelayan Tuhan adalah Lenka Utsugi, Tipe Baru yang Dewa Busurnya berbentuk pisau dan pistol.
Sekarang, sebagai salah satu senjata terbesar Fenrir, Lenka harus menguasai Dewa Busurnya jika dia ingin memenuhi keinginannya untuk menghapus Aragami sekali dan untuk selamanya. Monster-monster terus dilahirkan secara massal sementara sisa-sisa umat manusia berjuang untuk bertahan hidup di malam hari. Hanya God Eaters yang berdiri di antara Aragami dan penghancuran total umat manusia.